데이터 클린룸에서는 참여 조직마다 공동 환경에 데이터를 넣고, 어떤 쿼리를 실행할 수 있는지와 어떤 결과를 밖으로 가져갈 수 있는지를 미리 합의합니다. 참여자는 서로의 고객 단위 레코드가 아니라 건수나 중복률 같은 집계 결과를 봅니다. 결과마다 최소 집단 크기를 두거나, 쿼리 유형을 제한하거나, 경우에 따라 결과에 차분 프라이버시 노이즈를 더하는 방식이 흔히 쓰입니다.
가장 잘 알려진 쓰임새는 광고 성과 측정입니다. 유통사와 브랜드는 고객 명단을 서로 넘기지 않고도, 캠페인을 본 사람 가운데 몇 명이 나중에 제품을 샀는지 측정할 수 있습니다. 헬스케어 연구와 금융 서비스에서도 클린룸을 씁니다. 클린룸 덕분에 엄격한 규칙 아래에서도 데이터를 공유할 수 있지만, 같은 규칙 때문에 분석으로 얻을 수 있는 결과도 제한됩니다. 그래서 참여 조직은 분석이 답해야 할 질문을 미리 정합니다.